药学部下设门诊西药房、中药房、中心药房和临床药学室。现有30人，其中高级职称5人，主管（中）药师16人，形成一支专业性、高质素的技术队伍。

2019年完成了智慧药房的建设。中心药房和门诊西药房面向全院患者提供药品供应和药事管理工作；标识化管理、无纸化处方、信息化管理、上线处方合理用药自动审核系统，大大缩短了患者等候取药的时间，有效地降低运营成本，减少调剂差错，提高了工作效率。

中药房实行信息化和精细化管理，为患者提供远程调配、快递到家服务，推出中药饮片代煎服务，大大方便了就诊患者。同时，保证临床科室中药饮片粉剂的供应，在推广中医药特色服务方面成效显著。

临床药学室实行临床查房、病例讨论、用药咨询、处方点评、个体化给药方案制定、药学会诊等以患者为中心的服务模式；负责特殊药品管理、阳光用药管理、药品不良反应上报等工作，从制度建设、流程优化等多方面积极促进临床药学工作制度化、正规化，提升临床药师队伍能力水平。

药学部多名党员、青年骨干积极参加社会各类用药知识传播、宣教、知识竞赛等活动；获得省级临床合理用药技能竞赛奖项多个和市级奖项多个，同时获江门市青年文明号称号。